ФНС Российской Федерации разъяснила порядок работы с НДС по операциям при реализации товаров, работ и услуг, произведенных в процессе текущей деятельности должником, признанным несостоятельным (письмо ФНС РФ от 17 августа 2016 г. № СД-4-3/15110@ "О направлении пояснений").

В этом случае нужно руководиться нормами НК РФ, соответственно которым реализация имущества и (либо) имущественных прав банкрота НДС не облагается (подп. 15 п. 2 ст. 146 НК РФ). На это обращали внимание и суды (распоряжение Арбитражного суда Центрального округа от 26 марта 2015 г. № Ф10-2769/13 по делу № А68-5758/2012). Произведенная учреждением-банкротом продукция либо купленная им у других лиц кроме того не является налоговой базой при исчислении НДС, поскольку любое имущество, реализуемое или предназначенное для реализации, считается товаром. (п. 3 ст. 38 НК РФ).
К тому же, исполнение работ либо оказание услуг у такого рода хозяйствующих субъектов подвергается налогообложению этим косвенным налогом в простом режиме.
Напомним, что вычет НДС по получаемым товарам для текущей деятельности банкроту произвести не удастся. В этом случае действует норма НК РФ, по которой "входящий" НДС на имущество, приобретаемое для производства товаров (работ, услуг), операции по реализации коих не будут считаться предметом налогообложения по НДС, учитывается в стоимости таких товаров (работ, услуг), в частности основных средств и невещественных активов (подп. 4 п. 2 ст. 170 НК РФ).
Отметим, что до 1 января 2015 года НДС при реализации имущества банкротов взимался на общих основаниях (закон от 24 ноября 2014 г. № 366-ФЗ "О введении изменений в часть вторую НК РФ и обособленные законы РФ").